砂鍋是壹種密封效果較好的烹飪工具，在烹飪羊肉、排骨等香味較大的食物時會使氣味難以消散，從而影響食物的風味。而且有些有害物質，如脂肪酸，不能完全揮發，停留在食物和湯中，長期熱反應生成有害物質。
在制作砂鍋的過程中，會用到應時和長石等礦物質。有的砂鍋也是上釉燒制，這樣釉裏面就有壹些有害物質。這些物質會在砂鍋煮、燉食物的過程中滲透到食物中，從而影響人體健康，甚至引起慢性中毒。
而且砂鍋燉久了，營養成分的平均損失率會增加，尤其是壹些含有大量鈣、磷、鐵、鋅、碘、維生素C等無機鹽的蔬菜，營養成分會全部流失。因此，建議在吃砂鍋時，應加入生蔬菜和粗糧，以彌補營養的損失和不足。