春秋時，在今臨淮鎮附近建鐘離子國，並築鐘離城。周景王七年（公元前538年），楚攻占 鐘離城，鐘離屬楚。周敬王二年（公元前518年）鐘離城又被吳王僚奪去。越王勾踐滅吳後，鐘離城屬越，周顯王三十五年（公元前332年）楚滅越，鐘離城又屬楚。 秦統壹中國後，鐘離城屬九江郡。 西漢高祖四年（公元前203年）正式設鐘離縣。劉邦封英布為淮南王，改九江郡為淮南國，鐘離縣為淮南國的領地。 漢武帝元狩元年（公元前122年）平定吳楚七國之亂，殺淮南王劉安，改淮南國為九江郡，鐘離縣仍屬其管轄。王莽奪取西漢政權後，改九江郡為延平郡，將鐘離縣改為蠶富縣。東漢建武元年（25年）改稱鐘離侯國，後又稱鐘離縣，仍屬九江郡。 三國時，鐘離縣屬魏。 西晉時，屬淮南郡。東晉建武元年（317年）將九江郡分為九江、鐘離二郡。隆安年間（397—401年），改鐘離縣為燕縣，屬鐘離郡。 北齊天保元年（550年），改燕縣為鐘離縣。陳宣帝太建五年（573年）鐘離縣屬陳，太建十壹年（579年），北周攻占鐘離郡，鐘離縣屬揚州淮南郡。
（二）濠州（隋-元）
隋文帝開皇二年（582年），因鐘離地枕豪水，鐘離郡改稱豪州。大業三年，改豪州為 鐘離郡。隋末，為杜伏威的屬地，改鐘離郡為豪州。 唐高祖武德五年（622年）杜伏威降唐後，鐘離縣屬淮南道豪州。天寶元年（742年）改豪州為鐘離郡，乾元元年（758年），又改名豪州。唐元和三年（808年）改豪河為濠河，改豪州為濠州。 北宋時，鐘離縣初隸淮南路，後屬淮南西路濠州。南宋時由於金兵常南下在濠州壹帶騷擾，開禧二年（1206年）曾壹度把州治遷往定遠。 元朝時，鐘離縣隸河南行中書省安豐路濠州安撫司。至正十二年二月（1352年）郭子興領導農民軍占領濠州，至正十三年又被張士誠奪去。至正二十六年朱元璋打敗張士誠，濠州又為朱元璋所有。次年，朱元璋改濠州為臨濠府。
（三）鳳陽府（明-清）
明洪武二年（1369年），改鐘離縣為中立縣，同時在濠州西南鳳凰山南麓建中都。洪武三年因縣城北臨淮河，將中立縣改為臨淮縣，這是臨淮地名之始。洪武六年臨濠府改為中立府，洪武七年中立府改名鳳陽府，府治遷往新城，同時割臨淮縣的太平、清洛、廣德、永豐4鄉設鳳陽縣，洪武十九年將虹縣（今五河、固鎮壹帶）南8都並入鳳陽縣。據《明壹統誌》記載，鳳陽因在鳳凰山之陽，故名。自洪武七年至清乾隆十九年（1754年），今鳳陽縣境內為鳳陽府治和鳳陽、臨淮二縣地。鳳陽府，明初直屬中書省，永樂元年（1403年）改屬南京。 清順治二年(1645年)鳳陽府改屬江南省，康熙元年（1663年）改屬安徽省。乾隆十九年(1754年)將臨淮縣並入鳳陽縣。乾隆二十年，鳳陽縣屬安徽省鳳潁六泗兵備道，道員駐鳳陽。
（四）鳳陽縣（中華民國）
辛亥革命後，取消府的建制，鳳陽縣直屬安徽省。民國3年（1914年）設淮泗道，道尹駐鳳陽。民國21年設行政督察專員公署，簡稱專區，鳳陽縣屬第四專區。民國27年2月，府城被日軍占領，漢奸倪道烺在蚌埠組織“安徽省維新政府”，鳳陽縣直屬偽省府管轄，偽鳳陽縣政府設在蚌埠。民國29年“安徽省維新政府”改為“安徽省政府”後，設8個行政督察區，鳳陽縣屬第壹行政督察區。 抗戰時期，府城、臨淮關等城鎮雖被日軍占領，但在廣大的農村和山區，在***產黨的領導下，先後建立了定鳳懷縣、鳳定嘉縣、盱鳳嘉縣抗日民主政府，領導人民進行抗日鬥爭。抗戰勝利後，國民黨軍隊占據府城、臨淮關等城鎮，並向淮南津浦路西解放區發動進攻。民國35年8月，定鳳懷縣黨政機關，除留少數武裝工作人員堅持遊擊戰爭外，全部北撤，定鳳懷、鳳定嘉、盱鳳嘉等縣政府先後撤銷。民國36年元旦，蚌埠正式設市，從此蚌埠從鳳陽分離出去。 民國37年，定鳳懷縣政府重新成立，民國38年1月16日，鳳陽解放，2月，定鳳懷縣政府撤銷，鳳陽縣人民政府成立，鳳陽縣屬江淮第四專員公署，4月改屬定遠專區，7月改屬滁縣專區。
（五）滁縣管轄時期（1949年-1992年）
1949年後，鳳陽劃歸皖北行署滁縣專區。後皖北、皖南行署合並重建安徽省，鳳陽劃歸安徽省滁縣專區。 1956年，宿縣、滁縣兩專區合並成蚌埠專區，鳳陽縣屬蚌埠專區。1961年，蚌埠專區分為滁縣、宿縣兩專區，鳳陽縣屬滁縣專區。
（六）滁州市管轄時期（1993年-今）
1992年底，滁州市（地級）成立，鳳陽縣改屬安徽省滁州市。現在有蒙古族、回族、藏族、維吾爾族、苗族、彜族、壯族、布依族、朝鮮族、滿族、侗族、瑤族、白族、土家族、哈尼族、傣族、黎族、畬族、高山族、水族、納西族、土族、撒拉族、仡佬族、錫伯族、阿昌族、羌族、塔吉克族、京族等民族分布。（2000年人口普查）