蘇北琴書的音樂結構屬板腔體，主要曲牌鳳陽歌、銀鈕絲、穿心子、蓮花落，藝人在演唱過程唱腔逐漸發生流變，到清末民國初年已形成固定的唱腔，四句牌、垛子（快流水）二板（慢流水）悲調（哀憐口），四句牌壹般是四轉頭，有時根據情節，中間采取頓句不拖腔，成六句或八句轉頭，二板和垛子壹般是上下句，壹段唱詞壹氣貫下，到結尾時拖腔。
其伴奏樂器有：墜胡、揚琴、木板，主要樂曲有大八板、小八板、悲曲、過門。過門變化較大，隨著演員的唱腔變化和情節變化，有長有短，琴書伴奏樂的特點是伴奏時墜胡的上下把位滑動幅度大，尤其悲調伴隨演員的唱腔催人淚下。