和田地區博物館始建於1995年，館藏文物9066件，總建築面積為3400平方米，其中大展廳二個，小展廳六個，地下文物庫房1個，學術研究交流中心壹個。
博物館於2005年10月29日下午在新疆塔克拉瑪幹沙漠南緣的和田市舉行開館典禮，正式向國內外遊客開放。2006年8月25日二樓和田民俗陳列開館，得到了廣大國內外人士的關註，也是宣傳和田、對廣大遊客進行愛國主義教育的基地和對外開放的重要文化窗口。
據館長買提克日木·司馬義介紹：和田博物館現貯存各類文物、展品9499件，書籍600余本。其中國家級文物壹件，國家珍貴文物545余件，這些珍貴文物大都是新中國成立以來考古工作者在和田地區發掘獲得的，少部分由當地民間人士捐贈。因此可以說和田博物館是個綜合性的博物館。
和田地區古代為皮山、於闐、渠勒、精絕、戍盧諸國地，是塔克拉瑪幹沙漠南緣最大的綠洲。"和田博物館的館藏文物，真實地再現了歷史上和田地區燦爛輝煌的手工紡織技術、陶塑藝術、繪畫藝術、以及作為佛教聖地所蘊藏的佛教文化"，新疆維吾爾自治區文物局副局長艾爾肯·米吉提說。
大約在距今3000年左右，塔克拉瑪幹沙漠南緣的於闐建立了國家，在西漢時期（距今約2000年）尉遲家族稱王，統領於闐。公元前60年，歸西域都護府統轄，正式列入中國版圖。7世紀中葉，唐朝政府在天山以南設安西大都護府，675年在於闐設置毗沙都督府，下置十州。元為蒙古宗王分封地，1279－1289年，元政府在此設宣慰使元帥府。清乾隆24年（1759年）設和闐辦事大臣。1884年，新疆建省，置和闐直隸州，轄於闐、洛浦兩縣；新中國成立後，設和田地區，轄和田市以及和田、墨玉、皮山、洛浦、策勒、於田、民豐七縣。
大約在公元前，佛教傳入於闐，因國王尉遲家族虔誠信仰並極力弘揚，在於闐境內大力修建佛院、莊鑾佛像，彩繪壁畫，佛教在於闐取得至高無上的地位，於闐成為佛教的聖地。同時，大批的大乘經籍從於闐弘布到中原，成為中原大乘佛教的策源地。
隋唐時期分別在洛陽和長安從事繪畫創作的“大小尉遲”更將於闐佛教繪畫技藝帶到中原，“於闐畫派”吸收了印度、中亞的運染法，融匯中原繪畫的線條，又加入於闐本地的成分，形成獨辟蹊徑的繪畫風格，深遠地影響到我國佛教藝術的發展。
和田之地，是新疆古代文明的發祥地之壹，是古代“玉石之路”、“絲綢之路”的重鎮，中外經濟文化的薈萃之地。隨著歲月的流逝，遺址漸被流沙埋沒。在19世紀末至20世紀初三十年代，自瑞典人斯文·赫定始、英國人斯坦因、日本人桔瑞超、德國人特林克勒、椿克爾等來自外國的“探險家”、“考古家”先後蜂擁而至，尋覓文化遺存，盜掘文物，致使和田境內幾乎所有的古遺址都受到破壞，大批的精美文物流散海外，如英國倫敦博物館、新德裏印度國立博物館、德國不來梅博物館等，這成為新中國成立前和田考古文物工作的“傷心史”。
經過田野調查，和田地區有各類文物遺跡點約156余處，出土各類文物1萬多件，著名的遺址如皮山縣“桑株巖畫”、洛浦縣“山普拉古墓葬群”、“熱瓦克大塔”、墨玉縣“麻紮塔格遺址”、民豐縣“尼雅遺址”、於田縣“喀拉墩佛寺”、“原沙古城遺址”、策勒縣“丹丹烏裏克遺址”等。新落成的和田博物館珍藏了這些遺址出土的部分文物，為研究中國西域文明史提供了珍貴的實物資料。
2020年11月27日，和田地區和田市和田博物館確定為國家4A級旅遊景區。