2.2.1水生生物采集範圍
(1)浮遊植物調查包括定性調查和定量調查。浮遊植物色素的測定可以作為生物量的壹個重要指標。通過壹定的換算，也可以作為產量的指標。葉綠素的測定方法可分為分光光度法和熒光分光光度法。在萃取溶液、操作步驟、計算公式等方面也有區別，常用的是洛倫茨單色分光光度法。
(2)浮遊動物調查主要集中在四大類:原生動物、輪蟲、枝角類和橈足類。它們的種群和數量變化可以反映水體的富營養化程度。
(3)底棲生物調查主要包括對生活在河流、湖泊和海洋底部的動植物群落結構的調查。根據它們的生活方式，底棲生物可分為固定生活型、埋藏生活型、滴水生活型、鉆孔生活型和底遊生活型，如垂枝和蛇類。
(4)大型水生植物主要指水生維管束植物、大型藻類、蕨類植物等。
(5)水中的微生物可以反映水汙染的程度和水的營養水平。指示菌如大腸桿菌、糞大腸桿菌、糞鏈球菌、產氣莢膜梭菌、雙歧桿菌、腸道病毒、大腸桿菌噬菌體、沙門氏菌、誌賀氏菌、綠膿桿菌、葡萄球菌、副溶血弧菌等。
2.2.2水生生物的收集、處理和固定
1.浮遊植物
采樣時，定量樣品在定性采樣前用采水器采集，每個采樣點取1L水。當有大量沈澱物時，應在取樣前將其沈澱在容器中。大型浮遊植物的定性樣品由25號浮遊生物網緩慢拖曳采集於表層，網口垂直於水面，網口上端不應露出水面。浮遊植物樣品立即用魯格氏液固定，用量為水樣體積的1%-1.5%。需要保存帶回的樣品需要加入37%-40%的甲醛溶液。用量為水樣體積的4%。
2.浮遊動物
采樣時，原生動物、輪蟲和無節幼體的定量采樣可采用采集的浮遊植物定量樣品，如1L進行單獨采集。定性樣品采集方法與浮遊植物相同。枝角類和橈足類的定量樣品應先用水樣采集，然後再進行定性采樣。在每個采樣點，用25號浮遊生物網采集10-50L，過濾濃縮後裝入標本瓶。用過濾水沖洗過濾網三次，將所得濾液裝入上述瓶中。定性樣品被浮遊生物網13緩慢拖拽采集到表面。請註意，過濾網和定性樣本收集網應分開使用。原生動物和輪蟲的定性樣品固定方法與浮遊植物相同，只是留壹瓶用於活體觀察。枝角類和橈足類的定量和定性樣品應立即用37%-40%的甲醛溶液固定，用量為水樣體積的5%。
3.海底動物
抽樣可分為定量抽樣和定性抽樣。定量采樣，蝸牛、貽貝等大型底棲動物壹般用帶網的泥阱采集。采集泥樣後，應將網口關緊，用清水沖洗，清除網內泥沙，然後擡高水面，將螺、蚌等底棲動物全部挑出來。水生昆蟲、水生寡毛類和小型軟體動物。用改進的彼得森挖泥船收集。將收集到的所有泥樣倒入塑料桶或盆中，洗凈40目和60目篩，挑出篩上可見的所有動物。如果從取樣到分選需要2個小時以上，應在袋中加入適量的固定液。將塑料袋裝的泥樣逐壹倒入白色解剖盤中，加入適量的水，用吸管、鑷子、解剖針分類。如果帶回的樣本不能及時分類，可以低溫4℃保存。在每個采樣點，用上述兩個采樣器采集樣品2-3次。用醫用75%乙醇溶液保存軟體動物，4-5天後再次更換乙醇溶液。也可以用5%的甲醛溶液固定，但要加入少量的蘇打或硼砂來中和酸性甲醛。妳也可以取出內臟，保存空殼。水生昆蟲可用5%乙醇溶液固定，5-6小時後移入75%乙醇溶液保存。對於水生寡毛類，要放入培養皿中，加少量水，慢慢滴幾滴75%的乙醇溶液，使蠕蟲麻醉。在它們被完全拉伸和拉直後，應該用5%的甲醛溶液固定。保存在75%的乙醇溶液中。
4.附生植物
調查期間只進行定性檢查。主要刮擦或浸沒在玻璃水中，如表面藻膜、絲狀藻類和石頭、樹樁、樹枝、水生植物或硬沈積物的粘性生長物。采集附生植物時，如果水中有大量大型水生植物，會將整株水生植物采集帶回。從室內的植物根部依次刮掉植物上的所有生命體。此外，還可以用刀片或硬毛刷將水滴、石塊、木樁、樹枝等基質上的活體刮入裝有蒸餾水的樣品瓶中，然後將基質帶回室內刮取。附生藻類樣品的處理采用魯格氏液固定，用量為水樣體積的1%-1.5%。將原生動物樣品與基質壹起放入廣口瓶中，該廣口瓶含有來自取樣點的水樣，壹個瓶子用盧戈氏溶液固定。另壹個瓶子補充有用於體內觀察的固定劑。
5.大型水生植物
觀察采樣點大型水生植物的生長情況。選擇密集區、壹般區和稀疏區，布置采樣剖面。取樣斷面應平行或鋸齒形排列。挺水植物壹般采用1㎡的采樣箱采集。采集的時候，盒子裏的水草都是從底座上剪下來的。采集時，打開水草夾，插入水底，然後用力紮緊，用泥土把盒子裏的植物壹根根夾住，把淤泥沖洗幹凈，把網裏的水草清洗幹凈，裝進有編號的水草袋裏。在每個取樣點收集兩個平行樣品。去除汙泥等雜質，放入樣品袋中。沈水植物應該放入盛水的容器中。在大型水生植物的定心取樣中，手工采集挺水植物；用水草收集耙收集漂浮植物和沈水植物；漂浮植物直接用手采集或用手抄柄采集。