1.服務費收入，具體包括:第三方支付平臺對個人客戶轉賬、提現、信用卡還款等交易收取的服務費。例如，支付寶將對個人用戶向銀行卡(包括本人卡和他人卡)轉賬、提取賬戶余額從2016 10 12(具體收費標準略)收取費用；再比如微信支付。自2017 12 1之日起，每個自然月信用卡累計還款金額超過5000元的部分，向每個用戶收取0.1%(最低0.1元)，未超過5000元的部分繼續免費。
第二，第三方支付平臺為商戶或企業提供支付服務，POS機調配，資金查詢，轉賬支付，退款等交易。比如微信支付的商戶手續費標準中，不同行業的手續費率通常是結算金額的0.1%-1%，大部分是0.60%。而傳統POS刷卡的手續費率通常在1%-3%之間。上述兩部分收入是支付行業的傳統收入來源，其增長主要依靠規模效應。
3.客戶準備金的利息收入。消費者使用第三方支付平臺進行轉賬的過程中，由於結算周期的時間差，會有壹定的資金存入備付金賬戶。這部分資金的利息收入屬於第三方支付機構，但只能用於銀行存款和基金購買，不能用於借貸等投資。據WIND資訊統計，2017年備付金利息收入約占支付機構總收入的9.52%。其中占預付卡發行受理機構總收入的22.24%，占支付寶、微信等網絡支付機構總收入的11.26%，占銀行卡收單機構總收入的1.81%。
第四，隨著人民銀行逐步推進支付機構客戶備付金集中存管制度，第三方支付機構依靠存管資金獲取利息收入的空間會越來越小。
5.平臺衍生收入(或增值服務收入)。第三方支付平臺通過積累客戶信息、聚合交易信息、創造支付場景，衍生出互聯網營銷、征信、金融等增值服務，分別向企業客戶和個人客戶提供金融服務或產品銷售。比如螞蟻金服依托支付寶平臺，將業務拓展到小額貸款、網上銀行、網絡融資、網絡理財、保險等衍生領域。這類收益通常以“交易分成”的形式計算和實現。