2001年，戴逸、李文海等歷史學家再度呼籲國家編修清史。2002年8月，中***中央、國務院終於作出決定，正式啟動清史纂修工程。同年12月，國家清史編纂委員會正式成立，由戴逸出任編纂委員會主任。
2002年清史編纂委員會成立之後開始了新《清史》體裁體例的研究工作，到2004年為止大體確定了全書的總體框架。新《清史》由通紀、典誌、傳記、史表、圖錄五大部分組成，***92卷、3000余萬字。全書采用將《二十四史》經典體例與目前國際通用的章節體相結合的“新綜合”體進行編寫，其中通紀部分采用章節體，其余部分采用傳統體例。
《通紀》是全書的核心，分清建立、入關、康熙之治雍正改革、乾隆統壹中國、清朝中衰、外國侵略和農民戰爭、清自強運動、最後衰亡等各卷，描述清朝300年的盛衰史。《典誌》描述清朝典章制度及社會生活的各方面，具體包括天文歷法、地理、人口、民族、法律、農業、手工業、商業、外貿、交通、財政、學術、西學、詩文小說、戲曲書畫等。《傳記》部分分為22卷，包括清朝3000余位不同階級、領域的代表人物的傳記。《史表》包括“三十壹表”（實際包含35種表），在《清史稿》14種表（除《外戚表》）以外，又新設21種表。《圖錄》則是《清史》的重要創新之壹，分輿地、生產、商貿外貿、軍事、民俗、建築、藝術、宗教、肖像十大類，收錄各種歷史地圖、繪畫、文物圖片以及歷史照片等。