在義和團運動中，阻止了各國帝國主義列強瓜分中國野心，促進了中國廣大人民群眾的覺醒。但是由於具有籠統排外色彩和愚昧與殘暴，也使得歷史對義和團運動的評價較差。最初義和拳同當時清朝大部份秘密團體壹樣，反對滿族統治，以“反清復明”為口號，遭到鎮壓。隨著中國近代史形勢的發展，以帝國主義侵略為先導的西方勢力的沖突代替華夷之辯滿漢之爭成為主要歷史矛盾，義和團開始支持清朝抵抗西方，改名為“虎神營”，口號也改為“扶清滅洋” （1898年由趙三多首次提出）。義和團的起源有多種說法1、白蓮教說，這壹看法的代表是勞乃宣的《義和拳教門源流考》。認為義和團起源於白蓮教。2、大刀會說，大刀會是清代華北由貧苦農民為主的壹個團體，成員演練“金鐘罩”，認為可以刀槍不入，也被認為是義和團的起源之壹。
3、鄉團說，也有部分人認為義和團起源於民間的鄉團組織。
4、拳會說，在清代有許多傳播武術的民間團體，如義和拳、梅花拳等，特別是義和拳在長期發展中蒙上了濃厚的民間宗教色彩。被認為是義和團的前身。
教案頻發的原因主要有以下幾個：
①治外法權淩駕中國法律
世紀末，西方傳教士被準許在中國傳教和成立教會。在治外法權之下，不單教會的西方神職人員不受清政府管轄，壹般中國信徒也常獲教會庇護。地方上，基督教教會每每因為文化、風俗差異等等各種原因，與地方民眾發生沖突。部分不良教民欺壓當地民眾，而地方政府卻往往因為懼於教會的治外法權，不欲與洋人作對而未能持公處理，造成教案。
②仇外心態
清末華北地方經濟破產，傳統社會綱紀解體；在轉變的時代，人心惶惶，各式秘密會社紛起。總之，教會、教眾和洋人、洋貨，成為了仇視的對象。
③謠言
當時社會有許多詆毀西方人的謠言，如說洋人醫院挖小孩眼睛制迷藥、神父用特制器具吸男童陽精等等，而壹般中國百姓壹向迷信這類傳言，從而人人自危，對西方人及中國教友恨之入骨。
④守舊勢力煽動
教會除了傳教之外也興醫辦學、提倡破除陋習（如纏足納妾）、傳播新思想（如憲政、民主），與維新運動壹樣不可避免會引起守舊勢力的仇恨。
⑤教會自身問題
這些國家的政府曾經侵略中國，傳教士自然不受歡迎了。壹般來說，這些中國人最不能接受的，就是傳教士是在侵略條約的保護下進入中國的。更令人遺憾的是，有些外國政府用保護傳教士為借口，挑起爭端。其實傳教士來中國，只有壹個最重要的目的，就是將基督的愛帶給中國人，這是傳教士們積極傳福音、翻譯聖經、辦學校、開醫院從事社會服務等活動的唯壹目的，可惜中國人還是不能饒恕傳教士。1897年，在山東曹州教案中，就是德國首相命令天主教傳教士，在山東曹州設立教堂，藉此引起中國鄉民滋事，殺了兩個傳教士，造成德國政府威脅中國的借口。傳教士就這麽可憐的被利用了。以達到外國政府的卑鄙目的，以此鞏固自己的地位，保持自己的利益。
有壹些流氓假裝信主加入了教會，宣教士因為不了解底蘊，於是接受了他們，並為他們施洗。後來這些流氓打架，滋事還得到宣教士的保護，使中國人大大反感。後來傳教士明白了，不再甘心為虎作倀，但已經惹起中國人不少誤會，難以解除。此外，基督教傳教士和天主教傳教士吵架壹事，也帶來很壞的影響。在中國人眼中根本不分基督教和天主教的，這實在是很不好的見證。
⑥民族主義的刺激
從1860至1899年間，***有三次的反教高潮：光緒十年(1884)有48宗，光緒廿壹年(1895)有60宗，光緒廿四年(1898)有77宗。主要是受當時的中法戰爭、中日甲午戰爭、列強瓜分等事件的影響。