(2)客戶類型不同。在傳統的供應鏈管理模式下，企業服務的對象是固定的，供應鏈服務商可以清晰地把握客戶的類型及其所需的服務和產品。隨著電子商務的出現，需要快速、高速和詳細的物流和業務流程方法。顧客是未知的實體，他們根據自己的意願、季節需求、價格和方便程度來訂購產品。
(3)供應鏈運作模式不同。傳統供應鏈是典型的推式運作。為了克服貨物轉移在空間和時間上的障礙，制造商利用物流將貨物交付給市場或客戶。商流和物流都是推動的。在電子商務供應鏈中，商品生產、配送、倉儲、配送等活動都是根據客戶的訂單進行的。商流、物流、資金流都圍繞著市場，物流為商流提供了強有力的保障，所以拉動了電商供應鏈。
(4)庫存和訂單流程不同。在傳統的供應鏈運作模式下，庫存和訂單的流動是單向的，沒有買賣雙方互動和溝通的過程。在電子商務供應鏈條件下，客戶可以定制訂單和庫存，過程是雙向互動的。作為客戶，他們可以定制、監控甚至修改自己的庫存和訂單，而作為制造商和分銷商，他們也可以根據客戶的需求隨時調整自己的庫存和訂單，從而最大限度地提高供應鏈運作的績效。
(5)物流的目的地不同。在傳統供應鏈中，由於無法及時掌握商品流動過程中的信息，尤其是分散客戶的信息，缺乏個性化服務能力，物流只能實現集中批量運輸和無差別服務，運輸目的地集中。而電商供應鏈完全是按照個性化客戶的要求來組織商品的流動。這種物流不僅需要通過集貨將運輸成本降到最低，還需要通過差異化配送實現高服務，其目的地是分散的。
(6)供應鏈管理的要求不壹致。傳統供應鏈管理強調物流過程的穩定性和壹致性，否則物流活動就會混亂，物流運作中的任何波動和變異都可能給上下遊企業造成巨大損失。電商供應鏈管理則不同，因為其物流需求本身就是差異化的，物流是基於高度信息化管理的增值活動。因此，物流必然具有很強的季節性和不連續性，要求企業在管理物流活動時遵循反應及時、服務優質和總體成本最優的原則。
(7)供應鏈管理的職責不同。在傳統的供應鏈運作環境下，企業只對自己承擔的環節負責，比如運輸企業只關心有效運輸和相應的成本等。供應鏈各運作環節之間往往沒有明確的責任人，供應鏈運作活動分散，結果往往出現局部優化，整體績效不佳。而電子商務供應鏈強調供應鏈管理是壹種流程管理，要求企業從整個供應鏈的角度實施商品物流流程和相應的成本管理。
(8)物流信息管理系統不同。在傳統的供應鏈管理中，物流信息壹般是人工收集、傳遞和匯總的，信息是單向的，而供需信息是不對稱的。物流信息管理系統壹般是壹個單機系統，或者最多是壹個局限於內部網絡的局域網系統。電子商務環境下供應鏈管理中物流信息的收集可以由供需雙方通過Internet網絡在線進行，信息是雙向對稱的。信息管理系統是基於互聯網的對供需雙方開放的網絡系統，信息具有高度的實時性、準確性和有效性。
(9)資金結算方式不同。在傳統的供應鏈管理中，大部分資金以現金、支票或轉賬的方式結算；然而，在電子商務環境下的供應鏈管理中，在線電子支付是主要的結算方式，因為交易都是在網上進行的。